《绝代双骄1999》以江小鱼和花无缺这对孪生兄弟的传奇经历为主线。江小鱼自小在恶人谷长大，被十大恶人抚养，养成了古灵精怪、鬼马俏皮的性格。花无缺则在移花宫长大，气质高贵，武功高强，却也因此性格冷峻。两人本是兄弟，却因移花宫主邀月的阴谋，成为了互相敌对的存在。邀月一心想让两人自相残杀，以报复他们的父亲江枫。 在成长过程中，江小鱼结识了铁心兰、苏樱等女子，也与各路江湖人物斗智斗勇。花无缺奉邀月之命下山寻找江小鱼，在这个过程中，他逐渐对邀月的命令产生怀疑。两人在江湖中不断经历着爱恨情仇，最终在决战前夕，真相逐渐浮出水面。他们知晓了彼此的兄弟身份，共同对抗邀月的阴谋，最终化解了多年的恩怨，也收获了各自的爱情。