《不会拿捏距离的阿波连同学第二季》延续了第一季的青春恋爱喜剧风格。故事围绕着性格内向、不擅长拿捏人际距离的阿波连同学和她的同学水谷展开。在新的一季里，阿波连依旧在与水谷的相处中闹出不少可爱又有趣的误会。比如在一次班级活动中，阿波连误将水谷要参加的项目当成是两人的专属活动，结果在准备过程中闹出一连串笑话。水谷也在与阿波连的不断接触中，更加了解她内心的温柔与善良。他们之间的互动愈发频繁，感情也在这些小插曲中逐渐升温，同时，班级里其他同学的故事也穿插其中，为整个故事增添了更多欢乐与温馨的元素。