托马斯所在的林间空地幸存者们，在经历了前两关的残酷考验后，终于得知了WCKD组织的邪恶计划。在《移动迷宫3：死亡解药》中，他们为了拯救被病毒感染的同伴，也为了彻底摧毁WCKD组织，踏上了前往最后的避难所“极乐世界”的征程。托马斯、纽特、米诺等人一路遭遇重重危机，不仅有WCKD组织的疯狂追杀，还有被病毒感染后变成丧尸般的“鬼火兽”的袭击。途中，纽特不幸被病毒感染，他在人性即将丧失之时，请求托马斯结束自己的痛苦。最终，托马斯带领众人成功攻入WCKD总部，摧毁了病毒样本，也让真相大白于天下，人类迎来了新的希望。