《少年特工科迪》讲述了少年科迪的特工冒险故事。科迪本是普通少年，却因天赋异禀被招募进特工组织。他要一边应对校园生活中的学业压力、同学关系，一边执行各种危险的特工任务。在一次任务中，科迪被派去阻止邪恶组织盗取机密科技。他凭借聪明才智和敏捷身手，巧妙躲过敌人的重重陷阱与监视。在行动过程中，科迪结识了同样身为特工的伙伴，他们相互配合，共同面对困难。然而，敌人狡诈阴险，设下诸多圈套。但科迪始终不放弃，最终成功挫败敌人阴谋，保护了机密科技。他在一次次任务中不断成长，从青涩少年逐渐成为成熟特工。