《O记三合会档案》以香港警队O记打击三合会犯罪为背景展开。O记探员致力于打击猖獗的三合会势力，三合会在香港犯下诸多罪行，如收保护费、走私、贩毒等，严重扰乱社会秩序。探员们在调查过程中面临重重困难，三合会成员狡猾且凶狠，他们不仅要与三合会斗智斗勇，还要应对来自内部的压力和外部的威胁。 在一次大规模的扫毒行动中，O记探员锁定了三合会的一个重要毒品交易地点。然而，行动中却遭遇了三合会的埋伏，双方展开激烈枪战。尽管探员们英勇奋战，但还是有部分三合会成员逃脱。此后，O记探员们没有放弃，继续追查线索，深入三合会内部，最终成功捣毁了三合会的多个犯罪窝点，将主要头目绳之以法，维护了香港社会的安宁。