《都市桃运小神医》围绕主角展开一段充满奇幻色彩的都市之旅。主角本是身怀神奇医术的小神医，来到繁华都市后，凭借着自己的医术和智慧，在都市中站稳脚跟。他先是帮助了一位被疑难杂症困扰的富豪，从而获得了富豪的赏识和支持。此后，他不断卷入各种复杂的事件中，结识了形形色色的人物，有善良可爱的美女，也有阴险狡诈的反派。在这个过程中，他一边利用医术治病救人，一边与反派斗智斗勇。同时，他也收获了多段美好的感情，与几位性格各异的美女产生了情感纠葛。凭借着过人的医术和顽强的意志，他在都市中闯出了一片属于自己的天地。