《变身辣妹》的故事围绕着高中啦啦队队长珍和数学怪才韦恩展开。珍长相甜美，是校园中的风云人物，备受瞩目；而韦恩则性格内向，沉浸在自己的数学世界里，常被同学忽视。一次意外，珍和韦恩的灵魂发生互换。变成韦恩的珍，要面对陌生的学习环境和复杂的人际关系，还得参加数学竞赛；而变成珍的韦恩，进入了啦啦队，体验到了成为焦点的感觉。在这个过程中，两人逐渐理解了彼此的生活，也对自己有了新的认识。最终，他们克服重重困难换回了身体，也收获了成长与友谊。