《尸人庄杀人事件》围绕神红大学推理爱好会的叶村让和会长明智恭介展开。他们受电影研究社社长邀请，前往紫湛庄参加集训。然而，集训期间遭遇丧尸围城，众人被困。就在这危机四伏的环境中，杀人案件接连发生。先是电影研究社成员进藤被杀害在密室中，现场呈现出不可思议的状态。紧接着，其他成员也相继遇害。叶村让和少女侦探剑崎比留子携手，在丧尸威胁和杀人凶手的双重压力下，抽丝剥茧，破解一个又一个谜团，揭开凶手的真面目，在这场绝境中为生存和真相而战。