《神奇海盗团》的故事发生在 19 世纪，主角是海盗船长和他的一群性格各异的船员。船长一心渴望获得“年度最佳海盗”的称号，为此带着船员们踏上寻找宝藏的冒险之旅。他们驾驶着破旧的海盗船在大海上航行，途中遇到了各种稀奇古怪的事情。在一次偶然的机会中，他们绑架了查尔斯·达尔文。达尔文发现船长的宠物鹦鹉可能是一种新物种，便邀请他们前往伦敦。在伦敦，他们见识到了繁华的都市，也卷入了一场宫廷阴谋。船长在名利的诱惑下，差点迷失自我，但最终他还是坚守了海盗的初心，和船员们一起挫败了阴谋，带着荣誉和新的宝藏回到了大海。