《督军不好啦，小小姐又整活了》围绕古灵精怪的小小姐和严肃督军展开一系列趣事。小小姐生性活泼爱搞怪，总是想出各种新奇点子折腾府里上下。有一次，她为了体验江湖生活，在督军府里办起了“武林大会”，把府中众人弄得鸡飞狗跳。督军表面上对小小姐的胡闹十分头疼，总是板着脸训斥她，但内心却十分宠爱。在小小姐闯下大祸时，督军又会出面为她解决。随着故事发展，小小姐在督军的影响下逐渐成长，而督军也在小小姐的感染下变得更加有人情味，两人的互动温馨又搞笑。