《半城明媚半城雨第二季》延续第一季的奇幻古风故事。苏明眸依旧在半城努力经营着自己的胭脂铺，她善良聪慧，凭借着独特的制香技艺和真诚的为人，在城中积攒了不少人气。然而，半城看似平静的生活下实则暗流涌动。神秘组织再次现身，他们觊觎苏明眸手中的古老配方，妄图利用其谋取私利。与此同时，苏明眸与柳修文的感情也面临着新的考验。柳修文在追查神秘组织的过程中，陷入了危险境地。苏明眸为救柳修文，不得不深入神秘组织的老巢。在一系列惊心动魄的冒险中，苏明眸和柳修文相互扶持，不仅揭开了神秘组织背后的阴谋，还让半城恢复了往日的宁静，他们的感情也在磨难中愈发深厚。