《半妖倾城2》延续前作故事，民国乱世中，半妖聂倾城与人类明夏历经生死后重逢。然而，他们的爱情面临着更严峻的考验。神秘组织“幽瞳会”浮出水面，妄图利用半妖的力量达成不可告人的目的。幽瞳会四处抓捕半妖，倾城也成为他们的目标。与此同时，明夏的家族卷入了一场政治阴谋，他不得不周旋于各方势力之间。而倾城为了保护明夏和其他半妖，不断提升自己的能力。在这个过程中，他们结识了新的伙伴，也遭遇了强大的敌人。最终，倾城和明夏携手众人，与幽瞳会展开了一场惊心动魄的决战，守护了彼此的爱情和半妖与人类的和平。