《成神之日》的故事围绕着拥有特殊能力的少女佐藤雏展开。佐藤雏能读取他人的记忆，还能在一定程度上控制他人的行动。她来到了孤儿院院长的孙子架桥明日的家中借住。起初，明日对雏的能力充满怀疑，但随着一个个事件的发生，他逐渐相信并开始协助雏。他们利用雏的能力帮助他人解决各种难题，比如寻找失踪的物品、解开复杂的谜团等。然而，随着剧情推进，背后隐藏的巨大阴谋逐渐浮出水面。原来雏的能力来源并不简单，她的身世也与一个神秘组织有关。在与神秘组织的对抗中，明日和雏经历了无数艰难险阻，他们的友情也在这个过程中不断升华。