《毒枭：墨西哥第二季》延续前作，时间来到 1989 年，墨西哥毒品交易蓬勃发展，各方势力激烈角逐。联邦探员 Kiki Camarena 被残忍杀害后，美国缉毒局和墨西哥政府决心打击大毒枭米格尔·安赫尔·费利克斯·加拉多。此时的加拉多虽身陷囹圄，但他的毒品帝国仍在运转，手下各帮派为争夺地盘和利益纷争不断。其中，瓜达拉哈拉集团内部矛盾激化，各头目互不相让。美国缉毒局探员 Walt Breslin 等继续深入调查，与墨西哥官员合作，试图瓦解毒贩网络。在这一过程中，他们面临着毒贩的威胁、腐败官员的阻挠，甚至自身生命安全也受到严重挑战。同时，新崛起的毒贩势力也在伺机扩张，使得局势更加复杂混乱。各方在毒品利益的驱使下，展开了一场惊心动魄的较量。