《活佛济公3》延续前作风格，以济公济世救人的故事为主线。济公依旧疯疯癫癫却心怀慈悲，在人间惩恶扬善。剧中有多条故事线并行，比如天蚕魔君为祸人间，化身为董仲卿，与玉衡仙子展开一段爱恨纠葛，济公出手阻止天蚕魔君恶行，化解其与仙子的恩怨；还有天鹅精白雪和灵禅子转世的赵斌之间感情不断升温，他们一同协助济公降妖除魔。绿姬为报杀父之仇，联合大鹏鸟等妖怪对抗济公，济公凭借智慧和法力一次次将他们击败。在一个个故事中，展现了人性的善恶美丑，也传递了正义终将战胜邪恶的理念。