《杰克·莱恩第三季》中，CIA 分析员杰克·莱恩发现冷战时期的苏联秘密计划“美杜莎”被重启。该计划旨在让北约与俄罗斯开战，从而重塑苏联辉煌。杰克·莱恩在欧洲展开调查，他面临着来自各方的危险与阻碍。一方面，他要躲避俄罗斯情报机构的追捕，另一方面，还得应对神秘势力的暗杀。在调查过程中，他与老搭档伊丽莎白再度合作，两人携手揭开重重谜团。随着真相逐渐浮出水面，杰克·莱恩必须争分夺秒阻止“美杜莎”计划实施，避免一场可能的世界大战爆发，他能否成功化解这场危机成为全季最大看点。