《喜欢本大爷的竟然只有你一个？》围绕草壁哲矢展开。草壁哲矢是个平凡高中生，被女生们称为“本大爷”。学校里，美少女西园寺丽和可爱女孩日向葵都向他表白，这让他受宠若惊。然而，他很快发现这是一场阴谋。原来，西园寺是为了刺激喜欢的男生，日向则是被朋友怂恿。就在草壁陷入感情困境时，不起眼的丑女橘濑户花向他表明真心。草壁开始重新审视橘濑户花，在相处中逐渐发现她的美好，两人的感情也在日常点滴中慢慢升温。故事轻松幽默，又不乏青春的酸涩与甜蜜，展现了高中生复杂又纯真的情感世界。