《星际迷航：发现号第二季》延续前作剧情，主角迈克尔·伯纳姆所在的发现号飞船接到新任务。神秘信号出现，预示着可能存在威胁，舰队高层派发现号前去调查。在寻找信号源头过程中，飞船遭遇诸多挑战，遇到奇异外星生物和未知能量场。斯波克登场，他与伯纳姆的关系成为重要看点，两人在面对危机时既有理念冲突，又相互支持。随着调查深入，发现信号与神秘的红天使有关，红天使拥有超乎想象的能力，其身份和目的成谜。船员们在一次次冒险中，不断突破认知，探索宇宙的奥秘，也在危机中坚守着星际联邦的使命和价值观。