《雪之少女》围绕着转校生相泽佑一展开。佑一因童年好友的离世而内心封闭，来到七濑川町寄住在水濑秋子家中。在这里，他结识了许多性格各异的女孩。与泽渡真琴相遇后，佑一发现真琴有着超乎常人的单纯，她总是追逐着自己脑海中模糊的记忆。真琴会因为寻找自己想象中的母亲而四处奔走，佑一在陪伴她的过程中，逐渐打开了自己的心扉。 同时，佑一还与月宫亚由有诸多交集。亚由身体虚弱，总是在睡梦中徘徊，她一直期待着小时候承诺会回来的人。佑一在帮助亚由的过程中，两人的感情逐渐升温。随着故事推进，佑一慢慢揭开了小镇隐藏的秘密，以及他与这些女孩之间千丝万缕的联系，在这个满是雪的季节里，上演了一幕幕温暖又略带哀伤的青春故事。