《拉贝日记》以约翰·拉贝为主角展开故事。1937 年，侵华日军逼近南京，身为西门子公司南京代表处经理的拉贝，原本打算回国，但因妻子生病回国延期，从而见证了南京的惨烈。他与十几位外国传教士、医生、商人、教师等，共同建立了“南京安全区”，保护了超过 20 万中国难民。拉贝在日记中详细记录了日军的暴行，强奸、屠杀、抢劫等恶行令人发指。尽管面临日军的威胁，他依然坚守正义，尽力庇护中国百姓。最终，拉贝因纳粹身份被苏联逮捕，后在多方努力下获释，回到德国后生活困苦，但他始终保留着记录日军暴行的日记，为历史留下了铁证。