《秘密图纸》电影版围绕一份重要的国防工程秘密图纸展开。某科研单位的工程师陈亮携带图纸乘火车返回，途中图纸意外丢失。公安部门迅速行动，侦察员石云、雷振林等投入调查。石云在调查过程中发现了诸多可疑线索，比如火车站附近的神秘身影、一些看似平常却暗藏玄机的细节。随着调查深入，他们揪出了潜藏在内部的特务方莉。然而，案件远未结束，背后还有更大的阴谋和更狡猾的敌人。特务们妄图获取图纸，破坏国防工程。石云和战友们凭借智慧和勇气，与特务斗智斗勇，最终成功找回图纸，粉碎了敌人的阴谋，保卫了国家的安全。