《赛德克·巴莱(上)：太阳旗》以 20 世纪初台湾赛德克族反抗日本殖民统治的雾社事件为背景。马赫坡社头目莫那·鲁道，目睹族人受日本人压迫，心中复仇的火焰逐渐燃起。日本人强迫赛德克族男子服劳役、抢夺他们的土地，还羞辱赛德克族的文化与传统。莫那·鲁道的儿子达多也因反抗日本人被抓走。在这样的压迫下，莫那·鲁道决定带领族人反抗。他联合各部落，秘密筹备起义。在一次祭典上，莫那·鲁道看到日本人对赛德克族的轻视，更加坚定了反抗的决心。最终，赛德克族勇士们拿起武器，向日本殖民军发起了攻击，一场惨烈的战斗就此展开。