《花与爱丽丝杀人事件》围绕花与爱丽丝两位少女展开。花是个性格有些大大咧咧的女孩，爱丽丝则相对文静内敛，两人是好友。故事起始于一场意外，她们发现了一具尸体。面对这一突发状况，花和爱丽丝陷入了恐慌，但同时也激起了她们的好奇心。她们决定自己调查这起案件，在调查过程中，两人遇到了各种奇怪的人和事。她们穿梭于城市的各个角落，寻找线索，与嫌疑人斗智斗勇。随着调查的深入，真相逐渐浮出水面，而她们也在这个过程中经历了成长，友谊也变得更加深厚，最终解开了杀人事件背后的谜团。