《恶之教典序章》将故事聚焦于圣樱学园，教师莲实圣司看似是个完美教师，他教学认真，深受学生和家长的喜爱。然而，平静表象下却暗流涌动。学校里发生了一系列离奇事件，学生们之间的矛盾逐渐升级，一些隐藏的秘密也开始浮出水面。莲实圣司在处理这些事件的过程中，展现出了不为人知的一面。他的眼神中偶尔闪过的阴鸷，让他的真实目的变得扑朔迷离。随着剧情推进，观众会发现他的善良或许只是伪装，在这所看似美好的学校里，一场可怕的风暴正在悄然酝酿，而莲实圣司正是这场风暴的中心。