《亲吻姐姐》围绕高中生住之江圭太展开，他与双胞胎姐姐住之江亚香、住之江理香一同生活。亚香性格活泼开放，理香则相对内敛害羞，但两人都对圭太有着超越普通姐弟的感情。在学校里，圭太是个普通学生，却因姐姐们的过度亲密举动而时常陷入尴尬境地。比如在公共场合，亚香会突然亲吻圭太，引得旁人侧目。随着故事发展，圭太身边还出现了其他女生，她们也对圭太抱有好感，这让亚香和理香危机感倍增，从而引发了一系列搞笑又充满温情的故事，展现了青春期复杂又纯真的情感。