《不良教育》以佛洛迪的视角展开。佛洛迪是一位演员，导演恩里克找到他，希望他能出演一部根据自己童年经历改编的电影。恩里克回忆起在教会学校的时光，那里有严厉的神父，也有他和同学伊格纳西奥之间懵懂的情感。伊格纳西奥长相俊美，性格叛逆，他和佛洛迪在学校里一同经历着成长的烦恼与快乐。然而，学校里的压抑氛围和神父的不当行为，给他们的青春蒙上了阴影。后来，伊格纳西奥因家庭变故等原因经历了诸多波折。随着恩里克和佛洛迪深入回忆与探寻，一段被掩埋的过往逐渐浮出水面，涉及到欲望、背叛、救赎等复杂的情感与故事。