《南风知我意》讲述了为了寻找天然药物的药物研发员傅云深，在欠发达地区意外感染病毒，生命垂危之际被前往当地进行志愿医疗援助的外科医生朱旧所救。朱旧的善良和勇敢让傅云深心生好感，而傅云深的温柔与执着也打动了朱旧，两人在相处中渐生情愫。然而，傅云深回国后病情复发，他不想拖累朱旧选择离开。朱旧得知真相后，毅然决然地回到傅云深身边，陪他一起对抗病魔。在经历了重重困难和考验后，他们的爱情愈发坚定，最终携手走向了美好的未来。