《攻壳机动队 SAC_2045 持续可能战争》的故事设定在近未来，人类与电子机械的融合达到前所未有的程度。公安九课成员草薙素子与巴特等，负责处理各类复杂且危险的案件。此时世界处于“持续可能战争”状态，恐怖袭击、网络犯罪频发。在一次针对重要政要的刺杀事件中，九课展开调查，发现背后隐藏着一个庞大且神秘的组织，他们利用先进的电子技术操控人类意识，企图引发更大规模的混乱。草薙素子凭借自身出色的战斗能力和敏锐的洞察力，带领团队逐步揭开真相。在这个过程中，成员们不断面临生死考验，也对人类与机械融合后的存在意义产生更深思考。