《神枪少女第二季OVA》延续了第一季的暗黑风格与紧张剧情。故事围绕着社会福利机构“公安九课”展开，这里将失去生命希望的少女们改造成半机械的杀手，她们被称为“神枪少女”。在这一季OVA中，少女们继续执行着危险的任务。希安和恩里克这对搭档，在一次次枪林弹雨中相互配合，希安虽身体经过改造，但内心的纯真仍在，而恩里克则以自己的方式守护着她。同时，其他神枪少女们也面临着各自的挑战，有的要面对情感与任务的冲突，有的要在残酷的战斗中坚守自我。每一次任务都充满了不确定性和危险，少女们的命运也在不断地被改写，展现出了在黑暗世界中挣扎求生的残酷与无奈。