春日部防卫队受邀来到花之天下春日部学院参观，这里的学生们都彬彬有礼，校园氛围看似十分美好。然而，奇怪的事情却接连发生。学院里的学生们行为逐渐变得诡异，仿佛被什么神秘力量操控。小新和伙伴们决定展开调查，揭开背后的谜团。在调查过程中，他们遭遇了各种危险和挑战，还发现了学院隐藏的秘密基地。小新依旧发挥着他独特的搞怪风格，在关键时刻总能想出意想不到的办法。最终，春日部防卫队凭借着勇气和智慧，成功解开谜团，拯救了学院的学生们，让校园恢复了往日的生机。