《锦鲤萌宝大闹督军府》围绕着可爱机灵的萌宝展开。萌宝拥有锦鲤体质，所到之处总会有奇妙的好运发生。督军府中，督军严肃刻板，管理着府中的大小事务，规矩森严。萌宝误打误撞进入了督军府，他的天真无邪与督军府的严肃氛围形成了强烈的反差。萌宝在府中不断闯祸，一会儿打翻了督军心爱的古董花瓶，一会儿又把督军精心准备的重要文件弄得乱七八糟。但他的锦鲤体质也给督军府带来了意想不到的好处，比如让原本滞销的生意突然火爆起来。督军从一开始对萌宝的恼怒，到后来逐渐被萌宝的可爱和善良所打动，萌宝也在督军府中找到了家的温暖，上演了一系列温馨又搞笑的故事。