《刀剑神域外传 暴风之铳》的故事发生在射击游戏《Gun Gale Online》中。主角莲是一名身材高大且内向的少女，因过去的经历而自卑，在《Gun Gale Online》里她化身为娇小的少女形象“Pitohui”。在游戏中，莲结识了好友琪亚莉，她们一同参与各种战斗。游戏里存在着神秘的“死枪”事件，玩家会在现实中离奇死亡。莲和琪亚莉决定深入调查此事，在调查过程中，她们遭遇了各种危险的对手和艰难的战斗。她们凭借着出色的射击技巧和团队协作，不断突破困境，逐步揭开“死枪”背后的阴谋，在这个充满枪林弹雨的虚拟世界里，她们为了真相和正义而战，也在战斗中实现了自我成长和心灵的救赎。